電腦小白如何入門生信
電腦小白如何入門生信
大家好,我是謝大飛(全網同名hhh),也是公眾號生信漫漫學的作者。
很榮幸能有機會在老師的邀請下來和大家分享一下我的生信入門經歷,其實之前也有分享過生信小白如何入門,也在B站上面分享過自己做轉錄組分析以及寫論文的一些經驗。
可能在不熟悉的師弟師妹看來我已經是個生信入門級學徒了,但我沒有和大家說的是,其實我在讀研究生之前聯電腦都沒有接觸過。考上研知道自己要學生信的時候,才花三千塊錢買了一臺筆記本電腦。
生信學習經歷
其實真的很感謝當時選擇調劑的決定,從而能遇到我的導師,進而開啟了生信學習之路。
研究生沒有入學之前,導師就安排師兄線上給我們講解如何畫進化樹,此處cue一下我師兄,也就是江湖人稱賣萌哥,現在在技能樹講的萌老師。
第一次接觸進化樹的時候,用到的是電腦自帶的命令管理器,當時對在黑框框里面輸入命令讀取文件一竅不通,按照師兄教的步驟運行都還是報錯了,甚至解壓不開當時他給我們分享的壓縮文件。
后來提前去學校之后,在導師的遠程指導以及師兄的安排下,開始正式學習生信,我記得當時看的是山東大學的生物信息學的課程,然后當時師兄也給我推薦了B站一些up主,比如生信技能樹、生信曲線、學什么不好非得學生物。但我學習進度很慢,磨磨唧唧的學完了生物信息學的課程已經差不多開學了。
后來又接觸到小潔老師組織的生信星球學習小組,在每日作業的引領下算是慢慢接觸了R語言和的基本命令,也慢慢開始整理分享自己的學習筆記,當時應該是堅持學完了全程,因為學完發了筆記會獲得獎勵hhhh
通過生信學習小組入門之后,我就開始慢慢學習了轉錄組分析流程和網頁編程語言html等,因為研究方向是偏植物的,所以很多技能樹上的文章我當時都還看不懂,就也沒有仔細去研讀過。
與技能樹的淵源
真正開始技能樹并且跟著學習應該是研三上學期參加秋招之后,我發現想去的生信工程師崗位,基本上都是醫學或者腫瘤方面的。
所以我開始正式跟著技能樹學習,第一次全程跟下來的課程是去年十一月份,小郭老師開設的腫瘤外顯子數據分析的課程,因為我也是做重測序數據中變異位點信息挖掘的,所以還算是熟悉GATK的一個分析流程。
(這個目前尚未開放新課程,暫時無法報名,未來敬請期待)
但是跟完之后發現,我雖然能完成數據分析的流程,但卻并不能理解腫瘤外顯子的一些結果及需要關注的內容,加上后來研三畢業壓力太大就又擱置了學習。
直到上半年完成了小論文的發表,以及將畢業論文送盲審之后有點時間了,我又參加了小潔老師主講的數據挖掘的課程,開始系統的學習R語言,讓我對以前用到的一些命令,以及遇到的報錯有了更加明晰的理解,也整理相應的筆記發在了公眾號上。
但還是由于專業的差異,到了GEO數據挖掘部分,我很明顯的就感覺到了吃力,對于用到的代碼以及GEO數據庫,我除了課上要仔細聽之外,還需要自己去嘗試理解GEO數據庫,還好有小潔老師和曾老師耐心的指導和鼓勵,讓我有信心去學習一個新的知識。每次將整理好的筆記發在學習群里的時候,小潔老師和曾老師總會鼓勵和表揚我hhh,讓我有了堅持下去的動力。
目前數據挖掘的課程差不多快跟完了,又加入了生信入門班的學習,同時也在跟著生信技能樹的課程和推文在慢慢的學習單細胞。
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小鼠
如果說研究生階段的導師幫助我了解學習生信,并且鼓勵我完成了研究生學業,那么曾老師和小潔老師就是我生信學習路上的指引者,已鼓勵的教學方式,讓我有信心去學習一個全新的領域。
雖然說隔行如隔山,但我相信在生信技能樹的陪伴以及老師們的指導和鼓勵下,我一定能在生信學習的路上越走越遠的!
也祝生信技能樹越來越好,祝各位想要學習生信的小伙伴都能順順利利!