電腦小白如何入門(mén)生信

大家好，我是謝大飛（全網(wǎng)同名hhh），也是公眾號(hào)生信漫漫學(xué)的作者。

很榮幸能有機(jī)會(huì)在老師的邀請(qǐng)下來(lái)和大家分享一下我的生信入門(mén)經(jīng)歷，其實(shí)之前也有分享過(guò)生信小白如何入門(mén)，也在B站上面分享過(guò)自己做轉(zhuǎn)錄組分析以及寫(xiě)論文的一些經(jīng)驗(yàn)。

可能在不熟悉的師弟師妹看來(lái)我已經(jīng)是個(gè)生信入門(mén)級(jí)學(xué)徒了，但我沒(méi)有和大家說(shuō)的是，其實(shí)我在讀研究生之前聯(lián)電腦都沒(méi)有接觸過(guò)?？忌涎兄雷约阂獙W(xué)生信的時(shí)候，才花三千塊錢(qián)買(mǎi)了一臺(tái)筆記本電腦。

生信學(xué)習(xí)經(jīng)歷

其實(shí)真的很感謝當(dāng)時(shí)選擇調(diào)劑的決定，從而能遇到我的導(dǎo)師，進(jìn)而開(kāi)啟了生信學(xué)習(xí)之路。

研究生沒(méi)有入學(xué)之前，導(dǎo)師就安排師兄線上給我們講解如何畫(huà)進(jìn)化樹(shù)，此處cue一下我?guī)熜?，也就是江湖人稱(chēng)賣(mài)萌哥，現(xiàn)在在技能樹(shù)講的萌老師。

第一次接觸進(jìn)化樹(shù)的時(shí)候，用到的是電腦自帶的命令管理器，當(dāng)時(shí)對(duì)在黑框框里面輸入命令讀取文件一竅不通，按照師兄教的步驟運(yùn)行都還是報(bào)錯(cuò)了，甚至解壓不開(kāi)當(dāng)時(shí)他給我們分享的壓縮文件。

后來(lái)提前去學(xué)校之后，在導(dǎo)師的遠(yuǎn)程指導(dǎo)以及師兄的安排下，開(kāi)始正式學(xué)習(xí)生信，我記得當(dāng)時(shí)看的是山東大學(xué)的生物信息學(xué)的課程，然后當(dāng)時(shí)師兄也給我推薦了B站一些up主，比如生信技能樹(shù)、生信曲線、學(xué)什么不好非得學(xué)生物。但我學(xué)習(xí)進(jìn)度很慢，磨磨唧唧的學(xué)完了生物信息學(xué)的課程已經(jīng)差不多開(kāi)學(xué)了。

后來(lái)又接觸到小潔老師組織的生信星球?qū)W習(xí)小組，在每日作業(yè)的引領(lǐng)下算是慢慢接觸了R語(yǔ)言和的基本命令，也慢慢開(kāi)始整理分享自己的學(xué)習(xí)筆記，當(dāng)時(shí)應(yīng)該是堅(jiān)持學(xué)完了全程，因?yàn)閷W(xué)完發(fā)了筆記會(huì)獲得獎(jiǎng)勵(lì)hhhh

通過(guò)生信學(xué)習(xí)小組入門(mén)之后，我就開(kāi)始慢慢學(xué)習(xí)了轉(zhuǎn)錄組分析流程和網(wǎng)頁(yè)編程語(yǔ)言html等，因?yàn)檠芯糠较蚴瞧参锏?，所以很多技能?shù)上的文章我當(dāng)時(shí)都還看不懂，就也沒(méi)有仔細(xì)去研讀過(guò)。

與技能樹(shù)的淵源

真正開(kāi)始技能樹(shù)并且跟著學(xué)習(xí)應(yīng)該是研三上學(xué)期參加秋招之后，我發(fā)現(xiàn)想去的生信工程師崗位，基本上都是醫(yī)學(xué)或者腫瘤方面的。

所以我開(kāi)始正式跟著技能樹(shù)學(xué)習(xí)，第一次全程跟下來(lái)的課程是去年十一月份，小郭老師開(kāi)設(shè)的腫瘤外顯子數(shù)據(jù)分析的課程，因?yàn)槲乙彩亲鲋販y(cè)序數(shù)據(jù)中變異位點(diǎn)信息挖掘的，所以還算是熟悉GATK的一個(gè)分析流程。

（這個(gè)目前尚未開(kāi)放新課程，暫時(shí)無(wú)法報(bào)名，未來(lái)敬請(qǐng)期待）

但是跟完之后發(fā)現(xiàn)，我雖然能完成數(shù)據(jù)分析的流程，但卻并不能理解腫瘤外顯子的一些結(jié)果及需要關(guān)注的內(nèi)容，加上后來(lái)研三畢業(yè)壓力太大就又?jǐn)R置了學(xué)習(xí)。

直到上半年完成了小論文的發(fā)表，以及將畢業(yè)論文送盲審之后有點(diǎn)時(shí)間了，我又參加了小潔老師主講的數(shù)據(jù)挖掘的課程，開(kāi)始系統(tǒng)的學(xué)習(xí)R語(yǔ)言，讓我對(duì)以前用到的一些命令，以及遇到的報(bào)錯(cuò)有了更加明晰的理解，也整理相應(yīng)的筆記發(fā)在了公眾號(hào)上。

但還是由于專(zhuān)業(yè)的差異，到了GEO數(shù)據(jù)挖掘部分，我很明顯的就感覺(jué)到了吃力，對(duì)于用到的代碼以及GEO數(shù)據(jù)庫(kù)，我除了課上要仔細(xì)聽(tīng)之外，還需要自己去嘗試?yán)斫釭EO數(shù)據(jù)庫(kù)，還好有小潔老師和曾老師耐心的指導(dǎo)和鼓勵(lì)，讓我有信心去學(xué)習(xí)一個(gè)新的知識(shí)。每次將整理好的筆記發(fā)在學(xué)習(xí)群里的時(shí)候，小潔老師和曾老師總會(huì)鼓勵(lì)和表?yè)P(yáng)我hhh，讓我有了堅(jiān)持下去的動(dòng)力。

目前數(shù)據(jù)挖掘的課程差不多快跟完了，又加入了生信入門(mén)班的學(xué)習(xí)，同時(shí)也在跟著生信技能樹(shù)的課程和推文在慢慢的學(xué)習(xí)單細(xì)胞。

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小鼠

如果說(shuō)研究生階段的導(dǎo)師幫助我了解學(xué)習(xí)生信，并且鼓勵(lì)我完成了研究生學(xué)業(yè)，那么曾老師和小潔老師就是我生信學(xué)習(xí)路上的指引者，已鼓勵(lì)的教學(xué)方式，讓我有信心去學(xué)習(xí)一個(gè)全新的領(lǐng)域。

雖然說(shuō)隔行如隔山，但我相信在生信技能樹(shù)的陪伴以及老師們的指導(dǎo)和鼓勵(lì)下，我一定能在生信學(xué)習(xí)的路上越走越遠(yuǎn)的！

也祝生信技能樹(shù)越來(lái)越好，祝各位想要學(xué)習(xí)生信的小伙伴都能順順利利!